Aalykkeskolen blev indviet i 1904 og havde helt frem til 1945 navnet 'Kolding Kommunale Drengeskole'. Dette navn blev ændret til Aalykkeskolen, da skolen blev både en drenge- og en pigeskole. Skolen er tegnet af arkitekt Johan Christian Fussing.
Under Anden Verdenskrig var skolen helt eller delvist beslaglagt af tyskerne, hvilket betød, at undervisningen i reduceret omfang blev gennemført i forskellige lokaler rundt om i byen.
Elevtallet steg voldsomt i efterkrigstiden som følge af de store årgange, og i 1955 måtte skolen udvide. I 1962 havde skolen 1124 elever, fordelt på 46 klasser. Det var årsagen til, at Dyrehaveskolen blev bygget i 1964. I 1980erne var skolen lukningstruet, men i 2004 fik Aalykkeskolen bevilget en ny stor udvidelse, da en pavillon opført i 1969/1970 blev nedrevet for at give plads til en ny indskolingsfløj og nyt bibliotek.
