Oprettet 1996 under Sundhedsafdelingen til varetagelse af det sundhedsfaglige forebyggelsesarbejde i kommunen. I 1999 underlagdes AIDS- og alkoholsekretariatet Forebyggelsessekretariatet, der i 2006 blev nedlagt og underlagt Frederiksberg Sundhedscenter. Arkivet omfatter emneordnede sager, 1996-2003 samt udstillingsplancher, 1999.