Den medicinske funktion på hospitalet på Howitzvej blev antageligt oprettet i forbindelse med åbningen af den særlige hospitalsbygning i 1868. Ved udflytningen til hospitalskomplekset på Ndr. Fasanvej betegnedes afdelingen: Medicinsk Afdeling B.
Børneafdelingen blev oprettet i 1909, og herefter overført i 1959 til Børnehospitalet Fuglebakken. Afdeling B overførtes sammen med hospitalets øvrige afdelinger 1995 til Hovedstadens Sygehusfællesskab og fra 2007 til Region Hovedstaden.