VH 39-52. Kun enkelte sager er journaliseret. Sagerne en henlagt efter år og dato. Fra 1779-99 findes i hver årgang et særligt læg ´Direktionens sager´. 1816 findes en betydelig sag vedr. hospitalets pengeforhold. 1853 findes en tyk sag (begyndt 1784) vedr. salg af gods fra Københavns og Roskilde amter.
1702,05-07,09-11,13,15-21,38,66-67,74-76,1808-10 mangler.
En del af de manglende sager kan findes i særlige udskilte grupper: Private Vartov senge, Indlagte lemmer, Ansøgninger, Indlagte lemmers ejendele, Gæld og formue, Afdøde lemmers efterladte papirer, Afdøde lemmers efterladte ejendele, Kirker og skoler, Bygninger og inventar, Jordegodset, Regnskabsvæsen og Forskelligt.