Særprotokollen blev anvendt ved bedømmelsen af fremlagte arbejder i skrivning, tegning, kvindeligt håndarbejde og sløjd, når bedømmelsen skete inden det pågældende hold elever var gået op til mellemskoleeksamen.
For skrivning og regnings vedkommende desuden når de fremlagte arbejder skulle sendes til vedkommende censor, også selvom bedømmelsen foregik i samme eksamenstermin som eleverne aflagde deres mellemskoleeksamen.