I 1947 blev der givet bevilling opførelse af et kraft-varmeværk i Kalkbrænderihavnen. I 1952 og 1953 blev der givet bevillinger til udvidelse af værket. Værket blev sat i drift i 1953. Kapaciteten blev udvidet flere gange og i 1974 havde værket en kapacitet på 139.000 kW. I 1985 blev Svanemølleværket ombygget til at fyre med naturgas og letolie som reservebrændstof.
Den fjernvarme Svanemølleværket producerer, sendes primært ud i fjernvarmenettet som damp med et tryk på 10-15 bar. Værket kan også levere varmt vand via varmevekslere. Svanemølleværkets årsproduktion af el svarer til et gennemsnitligt forbrug i cirka 115.000 enfamiliehuse og varmeproduktionen til forbruget i cirka 40.000 enfamiliehuse.
I 2000 solgte Københavns Energi værket til selskabet E2.
