Han blev i 1903 gift med Elisabeth Rubin (datter af Marcus Rubin-se dennes privatarkiv, der ligeså er udskilt fra boghandler Einar Andersens privatarkiv).
Efter sin studentereksamen rejste Jacob Peter Jacobsen til København i 1889, hvor han i 1896 blev Cand. Mag med fransk som hovedfag. I 1903 blev han Dr. Phil. Fra 1903 til sin død var Jacob Peter Jacobsen ansat som sekretær ved Danmarks lærerhøjskole. Han udførte et betydeligt kulturhistorisk forfatterskab.