Kæmneriets hovedkasse er oprettet i henhold til reskript af 31. maj 1814, dvs. en kongelig befaling til Københavns Magistrat, og efterfølgende instruks i kancellibrev af 29. december 1814. Reskriptet drejede sig om ordningen af Københavns økonomiske forhold. Iflg. reskriptet skulle magistraten indrette en hovedkasse, som tog imod alle indtægter og sørgede for udbetalinger. Bestyrelsen af kassen lå under magistratens opsyn hos kæmneriet.
Kæmneriets Hovedkasse blev nedlagt i forbindelse med indførelsen af det såkaldte magistratsstyre i København. Det skete i medfør af Lov om Bestyrelsen af Kjøbenhavns kommunale anliggender af 4. marts 1857 og Vedtægt for Bestyrelsen af Staden Københavns communale Anliggender af 30. december 1857.
