Emdrup Skole blev oprettet 1940, som filial til Grundtvigsskolen. I 1942 blev den selvstændig.
Den 29. marts 1945 blev skolen beslaglagt af den tyske besættelsesmagt, der benyttede den til at huse tyske flygtninge. Skolen blev atter rømmet den 28. august 1945.
I 1979 blev Emdrup Skole og Emdrupborg Skole sammenlagt under navnet Lundehusskolen.
