Skolen i Charlottegården blev oprettet i 1981. I perioden 1981-82 blev den benævnt Specialafdelingen i Prinsesse Charlottegade. Skolen i Charlottegården tilbyder vidtgående specialundervisning i h.t. folkeskolelovens §20, stk. 2.
Eleverne er normalt begavede men har vidtgående indlæringsvanskeligheder. Det er elever, som har - eller har risiko for at få - sociale og følelsesmæssige problemer. Eleverne har funktionsvanskeligheder i forhold til alder og intelligens inden for følgende områder: koncentration, perception, kognition, hukommelse, sprog og motorik. Disse vanskeligheder betegnes i de fleste tilfælde som organisk betingede.
I 2008 flyttede skolen til den tidligere Frederikssundsvejens Skole.
