Den 16. marts 1945 blev skolen beslaglagt af den tyske besættelsesmagt, der benyttede den til at huse tyske flygtninge. Senere blev skolen benyttet som lazaret. Skolen blev rømmet den 27. august 1945.
I 1991 blev Amagerbro Skole og Sundbyvester Skole sammenlagt under navnet Amagerfælled Skole.
