Økonomidirektørembedet blev oprettet i forbindelse med forfatningsændringen af 1938 og kom under Overborgmesterens afdeling. Økonomidirektøren blev chef for Overborgmesterens sekretariat og var Regnskabsdirektør, dog ikke fra 1963 til 1965.
Økonomidirektørens hovedopgave er at være rådgiver for Københavns kommunalbestyrelse og overborgmesteren i spørgsmål af økonomisk karakter. Økonomidirektøren danner herudover - i det omfang dette skønnes hensigtsmæssigt - mellemled mellem overborgmesteren og de institutioner, der hører under overborgmesterens embedsområde.
Ved embedets oprettelse blev overborgmesterens sekretariat og direktoratet for stadens regnskabsvæsen samtidig lagt under økonomidirektørens ledelse. I tiden 1. april 1963-31. marts 1965 blev økonomidirektøren fritaget for den direkte ledelse af disse to institutioner, men siden 1. april 1965 hører ledelsen af overborgmesterens sekretariat igen til økonomidirektør-embedet.
Samtidig blev sagsområdet for sekretariatet udvidet til at omfatte en del af de opgaver, der efter 1. april 1963 var overladt til regnskabsdirektoratet. Fra 1. august 1965 og indtil videre hører den øvrige del af regnskabsdirektoratet også under økonomidirektørens ledelse.
I 1998 blev økonomidirektøren leder af økonomiforvaltningen.
