1997 Oprettet. Opdelt i Projekt- og driftskontoret og Borgerservicekontoret.
1998 Nedlagt. Opgaver overtaget af flere forskellige afdelinger.
Driftsopgaver vedrørende Miljøkontrollens egne anlæg, fondsanliggender samt varetagelse af borgerrelaterede kontakter og opgaver på miljøområdet.
Projekt- og Driftkontoret
Drift af afværgeprojekter, Kalvebod Miljøcenter, genbrugsstationer og støjlaboratorium samt skabedyrskontrol.
Borgerservicekontoret
Koordinering af lokalplaner, husholdningsaffald. lokal Agenda 21 og byøkologi. Derudover klagevagt og tilsyn med mindre lokale erhverv, specielt i forbindelse med klager over erhvervsaktiviteterne.