Anlægsafdelingen varetog arbejderne ved kloakanlæggenes udførelse og udførte detailprojekteringer af pumpestationer og kloakbygværker. Endvidere henhørte herunder afløbskontorets borearkiv, idet der blev foretaget undersøgelsesboringer for hele stadsingeniørens direktorat, og i tilslutning til de praktiske arbejder udførtes lejlighedsvis tekniske undersøgelser vedrørende betonstøbning m. m. Endelig førtes der tilsyn med private kloakanlægs udførelse.