Fiolteatret startede i 1961 i et gammelt vinlager i Fiolstræde 28. Teatret blev oprettet som eksperimentalteater af skuespillerparret Jan Zangenberg og Bodil Ellehammer sammen med arkitektparret Ole Leonardo Petersen og Mette Petersen. Det var Danmarks første intimscene. Den 1. forestilling blev vist 13. januar 1962.
I 1969 flyttede Fiolteatret til Halmtorvet 9 i Den Brune Kødby og begyndte også at opføre forestillinger uden for huset. Omkring samme tidsrum gik teatret over til kollektiv ledelse. Fiolteatret var fra ca. 1976-juni 1988 medlem af Den Storkøbenhavnske Landsdelsscene, fik herefter tilskud fra Teaterrådet og Københavns kommune og blev pr. 1. januar 1992 egnsteater for Københavns kommune.
Teatret kunne ikke klare sig økonomisk og ophørte i 1995.
Teatrets manuskripter og plakater er på Det Kongelige Bibliotek. Stadsarkivet har dubletter af nogle af plakaterne fra Det Kongelige Bibliotek.