Foreningen blev stiftet 1.9.1951 af dirigent Henning Madsen med navnet Bethesdas Strengekor. Navnet blev 11.10.1956 ændret til Musikkoret Bethesda. Musikkorets tilknytningsforhold til Københavns Indre Mission ophørte 1.1.1992, hvor det blev et selvstændigt kor og orkester med navnet Musikkoret København. Henning Madsen ledede koret 1951-1994, hvorefter Louise Adrian overtog ledelsen.