Ifølge reskript af 14. august 1801 blev magistratens administration fordelt på fire hovedfag, der fik hver deres borgmester. 15. februar 1805 blev denne ordning nedlagt, og magistratens opgaver blev i stedet fordelt på to sekretariater.
Magistratens 3. hovedfag havde ansvaret for følgende områder: - Afgifter - Ansøgninger om betjeninger (bestillinger) - Bistrup Gods - Borgerskab - Brandkontingent af de på stadens broer (udenbys kvarterer) assurerede bygninger - Kæmneriet - Lønninger - Pensioner - Skatter - Syns- og taksationsforretninger