Klinikken blev oprettet i 1971, hvor den overgik fra Dronning Louises Børnehospital til at være kommunal. Den blev også benævnt Ambulatoriet for endokrine lidelser og stofskiftesygdomme hos børn. Klinikken blev i 1974 overført til Børnehospitalet på Fuglebakken, endocrinologisk klinik for børn (nedlagt endeligt i 1983).