1999 Oprettet. Fra Kortlægningsafdelingen (4205.005) og Bygnings- og Boligregister (4205.010).
Geodatakontoret administrerede og vedligeholdte Københavns Kommunes digitale tekniske kort, bygnings- og boligregister (BBR) samt krydsreferenceregister (KRR).
Desuden fastsattes adgangs- og enhedsadresser ved tildeling eller ændring af husnumre, henholdsvis etagebetegnelser, sidebetegnelser eller dørnumre. Geodatakontoret udviklede, erhvervede og formidlede kort- og geodataprodukter, herunder digitale storskalakort i 2D og 3D, digitale bygnings- og terrænmodeller, ortofotokort, oversigtskort samt adresse- og vejdatabaser, til brug i kommunens forvaltninger og til salg til eksterne brugere.
Desuden administreredes brugsrettigheder til egne og eksternt erhvervede kort- og geodatabaser. Geodatakontoret varetog ophavsretten til egne kort- og geodataprodukter og fremstillede bogtrykte kort i forskellige målforhold og med behovsbestemt udgivelsesfrekvens. Endelig blev der ydet kartografisk rådgivning og produktion ved tilrettelæggelse og fremstilling af tematiske kort.